El asentamiento humano dentro del actual territorio de La Magdalena Contreras en México, se remonta al año 1276 en el que los aztecas son expulsados, asentandose el pueblo mexica en las inmediaciones de un cuerpo de agua, en el lugar llamado Atlitic , cuyo significado es ” piedra de agua”, desarrollandose los cultivos en las laderas del actual rio Magdalena y creando los poblados de Aculco, Ocotepec y Totolapan.
Consumada la conquista y la evangelizacion a cargo de los franciscanos, se promovio la construccion de un templo erigido a Santa Maria Magdalena “, poniendo el pueblo de “Atlitic” bajo su proteccion, por lo que desde este momento, se le denomino la Magdalena de Atlitic.